استاد کارگاه آموزشی دینامیک مولکولی
دکتر جواد زمانی؛ دکتری زیست فناوری از پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری
مدت زمان دوره: ۳ ساعت
به همراه صدور گواهی از طرف پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری به زبان انگلیسی
دینامیک مولکولی یک روش محاسباتی قدرتمند است که به مطالعه رفتار و حرکت مولکولها در طول زمان میپردازد. این تکنیک با استفاده از شبیهسازیهای کامپیوتری و میدانهای نیرو، میتواند جزئیات دقیقی از ساختار، پایداری و تعاملات مولکولی را فراهم کند. در این دوره، شما با تعاریف و کاربردهای دینامیک مولکولی آشنا خواهید شد و یاد خواهید گرفت که چگونه از این تکنیک برای مدلسازی پروتئینها و لیگاندها استفاده کنید. این دانش به شما امکان میدهد تا فرآیندهای زیستی پیچیده را در سطح مولکولی درک کنید و به تحلیل دقیقتری از دادههای تجربی دست یابید.
اهمیت مطالعه دینامیک مولکولی در تحقیقات و صنایع وابسته به علوم زیستی بسیار زیاد است. این روش به پژوهشگران کمک میکند تا رفتارهای مولکولی را پیشبینی کنند، داروهای جدید طراحی کنند و تعاملات پروتئین–لیگاند را بررسی نمایند. در این دوره، با میدانهای نیروهای مورد استفاده در دینامیک مولکولی و مراحل آمادهسازی پروتئین و لیگاند برای شبیهسازی آشنا میشوید. همچنین، با دستورات پرکاربرد سیستم عامل لینوکس که برای اجرای شبیهسازیها ضروری است، آشنا خواهید شد. پس از انجام شبیهسازیهای کاهش انرژی، NVT و NPT، شما قادر خواهید بود نتایج دینامیک مولکولی را تحلیل و تفسیر کنید و آنها را برای استفاده در پروژههای پژوهشی و صنعتی آمادهسازی نمایید. این مهارتها در طراحی دارو، مهندسی پروتئین و بسیاری از زمینههای دیگر علوم زیستی کاربردهای وسیعی دارند.
سرفصل های کارگاه آموزشی دینامیک مولکولی
- دینامیک مولکولی؛ تعاریف و کاربردها
- آشنایی با میدان نیروهای مورد استفاده در دینامیک مولکولی
- آماده سازی پروتئین و لیگاند برای دینامیک مولکولی
- مقدمه ای بر سیستم عامل لینوکس و معرفی دستورات پرکاربرد
- انجام کاهش سازی انرژی، NVT و NPT بر روی سیستم
- تحلیل نتایج دینامیک مولکولی و آماده سازی نتایج
دیدگاهها
هیچ دیدگاهی برای این محصول نوشته نشده است.