هوش مصنوعی و یادگیری ماشین نقش مهمی در تجزیه و تحلیل داده‌های میکروبیوم انسانی ایفا می‌کنند. این فناوری‌ها قادرند حجم بزرگی از داده‌های میکروبیوم را با سرعت و دقت بالا تحلیل کنند و الگوهای مخفی را شناسایی کنند که ممکن است با روش‌های سنتی قابل تشخیص نباشند. با استفاده از یادگیری ماشین، پژوهشگران می‌توانند پیش‌بینی‌های دقیقی در مورد تاثیرات میکروبیوم بر سلامت انسان انجام دهند و درمان‌های شخصی‌سازی شده را توسعه دهند. پایگاه‌های داده میکروبیوم، اطلاعات گسترده‌ای در مورد تنوع و فراوانی میکروارگانیسم‌ها در محیط‌های مختلف بدن فراهم می‌کنند که مقدمه‌ای برای آنالیز داده‌های میکروبیوم است. این تحلیل‌ها به شناسایی گونه‌های مهم میکروبی، درک تعاملات آن‌ها و ارزیابی تاثیرات مداخله‌های مختلف بر میکروبیوم کمک می‌کنند، که در نهایت می‌تواند به بهبود سلامت عمومی و توسعه محصولات جدید در صنعت بهداشت و درمان منجر شود.